Нинішня будівля Кілійського закладу загальної середньої освіти №3 введена в експлуатацію у вересні місяці 1983 року.

Заклад складається з будівлі та пришкільної території. Станом на 01.09.2023 р. в закладі функціонують 39 навчальних кабінетів, в тому числі кабінети української мови та літератури, біології, фізики, хімії, 2 кабінети інформатики (на 13 навчальних місць кожний), 3 кабінети іноземної мови, історії, мистецтва, захисту України, трудового навчання, майстерні, спортивна та актова зали, шкільна їдальня. До послуг здобувачів освіти працює бібліотека, освітній ХАБ, заклад оснащений сучасним спортивним майданчиком, в складі якого майданчик для міні-футболу з штучним газоном та територія для воркауту. Для дітей з ООП є кабінети практичного психолога, логопедичний кабінет та ресурсна кімната. 

Загальна площа земельної ділянки складає 25 138 м² , в тому числі: під будівлею закладу - 3 584 м² , під двором - 21 510 м² .

Площа учбових приміщень складає 2 916 м², неучбових та підсобних приміщень - 1094,7 м²